Od pierwszego przypadku choroby koronawirusowej, w grudniu 2019 r., choroba pandemiczna rozprzestrzeniła się na miliony osób na całym świecie.Ta globalna pandemia powieściciężki ostry zespół oddechowy koronawirus 2 (SARS-CoV-2)jest jednym z najbardziej fascynujących i niepokojących globalnych kryzysów zdrowotnych współczesności, stwarzającym ogromne zagrożenia dla świata i wpływającym na wszystkie aspekty życia ludzkiego.[1]
Koronawirusy to otoczkowe, dodatnio sensowne, jednoniciowe wirusy RNA z rodziny Coronaviridae, które mają szerokie spektrum żywicieli, takich jak ludzie, nietoperze, wielbłądy i gatunki ptaków, w tym zwierzęta gospodarskie i zwierzęta towarzyszące, stwarzające zagrożenie dla zdrowia publicznego. 1 Koronawirusy klasyfikuje się w podrodzinie Orthocoronavirinae, która jest dalej podzielona na cztery rodzaje w oparciu o różnice w sekwencjach białek: a-koronawirus, b-koronawirus, g-koronawirus i d-koronawirus.Koronawirusy a i b-koronawirusy zakażają tylko ssaki, podczas gdy koronawirusy g i d-koronawirusy zakażają głównie ptaki, chociaż niektóre z nich mogą zakażać ssaki.HCoV-229E,
oV-OC43, HCoV-NL63, HCoV-HKU1, SARSCoV, MERS-CoV i SARS-CoV-2 to siedem koronawirusów, które zidentyfikowano jako infekujące ludzi.Wśród nich SARSCoV i MERS-CoV, które pojawiły się w populacji ludzkiej w latach 2002 i 2012, są wysoce patogenne.Podczas gdy ludzki koronawirus (HCoV)-229E, HCoV-NL63, HCoV-OC43 lub HCoV-HKU1 krążący w populacji ludzkiej powodują jedynie przeziębienie7, koronawirus 2 ciężkiego ostrego zespołu oddechowego (SARS-CoV2), czynnik sprawczy COVID-19 to nowy koronawirus typu B, który pojawił się wcześnie pod koniec 2019 r. i spowodował wyniszczającą liczbę ofiar śmiertelnych.Podstawowe objawyCOVID 19są podobne do SARS-CoV i MERS-CoV: gorączka, zmęczenie, suchy kaszel, ból w górnej części klatki piersiowej, czasami biegunka i duszność.W przeciwieństwie do przeszłościzakażeń koronawirusem (CoV)., szybkie rozprzestrzenianie się na całym świecie, wysoki wskaźnik przenoszenia, dłuższy czas inkubacji, więcej bezobjawowych infekcji i ciężkość choroby SARS-CoV-2 wymagają dogłębnej wiedzy na temat wirusowych strategii unikania odporności.
Podobnie jak inne ludzkie koronawirusy (SARS-CoV-2, MERS-CoV), SARSCoV-2 ma również jednoniciowy genom RNA o dodatniej polaryzacji o wielkości około 30 kb.Jak pokazano na ryc. 1, wirusowe białka nukleokapsydu (N) łączą genom w duży kompleks rybonukleoprotein (RNP), który jest następnie otoczony lipidami i białkami wirusowymi S (kolec), M (błona) i E (otoczka).Na końcu 50 genomu znajdują się dwie duże otwarte ramki odczytu (ORF), ORF1a i ORF1b, kodujące polipeptydy pp1a i pp1b, które są wytwarzane w 16 białek niestrukturalnych (NSP) obejmujących każdy aspekt replikacji wirusa przez proteazy wirusowe NSP3 i NSP5, które zawierają domena proteazy podobnej do papainy i domena proteazy podobnej do 3C.9 Koniec 30 genomu koduje białka strukturalne i białka dodatkowe, z których udowodniono, że ORF3a, ORF6, ORF7a i ORF7b są zaangażowanymi wirusowymi białkami strukturalnymi w tworzeniu cząstek wirusowych, a ORF3b i ORF6 działają jako antagoniści interferonu.Zgodnie z obecną adnotacją na podstawie podobieństwa sekwencji do innych b-koronawirusów, SARS-CoV-2 zawiera przewidywania dotyczące sześciu białek pomocniczych (3a, 6, 7a, 7b, 8 i 10).Jednak nie wszystkie z tych ORF zostały jeszcze zweryfikowane eksperymentalnie, a dokładna liczba genów dodatkowych SARS-CoV-2 jest nadal kwestią sporną.Dlatego nadal nie jest jasne, które geny dodatkowe faktycznie ulegają ekspresji w tym zwartym genomie.[2]
Wysoce czułe i specyficzne testy mają kluczowe znaczenie w identyfikacji pacjentów z Covid-19 i zarządzaniu nimi, a także wdrożeniu środków kontrolnych w celu ograniczenia epidemii.Testy molekularne w miejscu opieki (POC) mogą umożliwić wcześniejsze wykrycie i2 izolację potwierdzonych przypadków SARS-CoV-2 w porównaniu z laboratoryjnymi metodami diagnostycznymi, ograniczając w ten sposób przenoszenie wirusa w gospodarstwach domowych i społecznościach.
[1]Kliniczne i operacyjne skutki szybkiego przyłóżkowego wykrywania SARS-CoV-2 na oddziale ratunkowym
[2] Bitwa między gospodarzem a SARS-CoV-2: odporność wrodzona i strategie unikania wirusów
Czas publikacji: 25 maja 2022 r